黑死病是怎么传播到欧洲的，最普遍的说法是基于一位名叫加布里埃尔·德·穆西的意大利公证人的记述。他的著作《瘟疫史》（Historia de morbo）写于1348年或1349年初，将瘟疫的传播归咎于金帐汗国的蒙古人（他称之为鞑靼人）。他们对热那亚控制的港口卡法进行围攻，该港位于克里米亚，现在叫费奥多西亚。
穆西说，1346 年瘟疫袭击蒙古人的军营时，蒙古人已经围攻该港口三年之久。他们于是将染疫而死的尸体放入投石机中，抛入城内，希望能杀死城内的所有人。水手和商人逃离了卡法，但他们将疾病带到了威尼斯和热那亚等地，导致疫情迅速蔓延。
尽管这一说法看起来很有逻辑，但它也引发了一些问题。首先，这个加布里埃尔·德·穆西一直在意大利的皮亚琴察生活和工作，远离黑海，对卡法守城的细节怎么会知道的这么清楚。其次，如果瘟疫在1346年就在卡法爆发了，怎么过了12到18个月才传入欧洲？病人或病鼠似乎都坚持不了那么长时间。
结合当时拜占庭、热那亚、威尼斯和马穆鲁克在黑海地区的居民和旅行者写下了书信、外交报告、法律文件、编年史和回忆录，卡法应该是被围攻了两次，第一次是在1344年2月，第二次是在1346-47年。第一次围攻期间，蒙古人使用了十二台投石机，但进攻很快结束。而第二次围攻的记载没有提到任何投石机等攻城机械。似乎加布里埃尔·德·穆西把两次围攻合并为一次事件。其他资料，比如卡法居民写给热那亚的一封信，表明瘟疫应该是第二次围攻结束后才袭击该城。
如果卡法不是瘟疫传入欧洲的来源，那么它是从哪里来的？现代有学者提出了一个新理论：亚速海最西端的港口塔纳。与卡法一样，这个港口被热那亚和威尼斯商人主导，他们在这里购买各种商品，如丝绸、香料，最重要的是粮食。热那亚和威尼斯等商业城邦需要进口大量粮食来供应居民，十四世纪的黑海周边地区是他们的主要粮食来源，多达三分之一的谷物来自这一地区。
黑死病在 1346 年蔓延到塔纳，但最初并没有波及意大利商人。因为威尼斯和热那亚对金帐汗国及其港口实施了贸易禁运，以报复他们对卡法的攻击。金帐汗国也对意大利人实施了禁运，因此 1346 年的贸易实际上被切断了。正因如此，当年欧洲并没有发生瘟疫。
但到1347年，意大利和黑海之间的贸易再次开放。由于城市面临粮食短缺，船队被派往塔纳，受命只采购买粮食。1347年7月或8月，粮食收获后，被储存在塔纳，然后由威尼斯和热那亚的船只运走。这些船还带走了生活在这些储存区的老鼠，以及携带鼠疫杆菌的跳蚤。
威尼斯和热那亚的船只需要几个月的时间才能返回母港。当他们在西西里和那不勒斯等地停靠时，这些船员将疾病首先传播给了当地。墨西拿的一位编年史家说，当十二艘热那亚战舰在1347年10月到达该港口时，“任何与热那亚人交谈的人都会感染这种致命的疾病，无法避免死亡……呼吸在交谈者之间传播感染，一个人感染另一个人，受害者似乎一下子就被疾病击倒了。”
热那亚舰队于11月抵达热那亚，该城很快爆发了疫情。而威尼斯直到第二年的2月底或3月初才遭到袭击。这是由于热那亚作为卡法的殖民者，在1347年初就与金帐汗国达成和平协议，较早恢复黑海北部的粮食运输。其商船在1347年8月装载新收粮食后，沿第勒尼安海航线快速返回，导致疫情在11月即爆发。
而威尼斯与金帐汗国的谈判较晚（1347年12月才正式签约），1347年4月才部分解除禁运，且仅允许从塔纳出口粮食。其商船需绕道克里特、墨东等地，停靠更多港口（如拉古萨/杜布罗夫尼克），航行时间更长，导致瘟疫延迟至1348年2-3月才传入威尼斯。
因此，并非蒙古人对卡法的围攻和将感染尸体抛入城中的“生物恐怖主义”将黑死病传入欧洲。相反，战争导致的贸易禁运事实上延缓了瘟疫扩散。“只有在和平恢复、禁运解除、1347年的粮食收获开始运输时，黑死病才跨越黑海进入地中海。它是和平的意外后果。”
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