口腔烧灼综合征的发病率大约4%。女性发病率是男性的3-7倍，最常见于60-69岁人群，30岁以下极其罕见。口腔烧灼综合征往往自发性出现，没有诱因，不过有一些因素会增加患病的风险，包括最近生病，患有纤维肌痛、帕金森病、自身免疫病和神经病变，做过牙科手术，食物过敏，药物，创伤性生活事件，压力，焦虑，抑郁等。 口腔烧灼综合征分原发性和继发性。 原发性口腔烧灼综合征或特发性口腔烧灼综合征没有临床或实验室异常，就是说除了病人自己描述的感觉之外，找不到病因。有的研究认为与味觉、周围神经系统或中枢神经系统的感觉神经有关。 继发性口腔烧灼综合征是由其他原因引起的，这些原因包括口干症，其他口腔问题比如扁平苔癣、鹅口疮和地图舌，缺乏铁、锌、维生素B9、维生素B1、维生素B2、维生素B6和维生素B12，食物过敏反应，胃食道反流，某些高血压药物，有挤舌、咬舌尖、磨牙等习惯，糖尿病或甲减，口腔过度刺激比如过度刷牙、用漱口液过度、喝过多的酸性饮料等，存在焦虑、抑郁或压力。假牙不会导致口腔烧灼综合征。
