用于发酵过程作为活细胞催化剂的微生物，包括细菌、放线菌、酵母菌和霉菌四大类。来源于自然界大量的微生物，从中经分离并筛选出有用菌种，再加以改良，贮存待用于生产。

菌种扩大培养的目的是提供足够菌种。发酵时间的长短和接种量的大小有关，接种量大，发酵时间则短。将较多数量的成熟菌体接入发酵罐中，就有利于缩短发酵时间，提高发酵罐的利用率，并且也有利于减少染菌的机会。因此，种子扩大培养的任务，不但要得到纯而壮的菌体，而且要获得活力旺盛的、接种数量足够的菌体。

菌种保存的方法

1、斜面低温保藏法

（1）将菌种接种到适合的固体斜面培养基上，等到菌种充分生长过后，使用油纸将棉塞部分包扎好，然后转移至2-8℃的冰箱中进行保存。

（2）如果是霉菌、放线菌及有芽孢的细菌，一般可以保存2-4个月左右，需要移种一次。如果是酵母菌，一般可以保存2个月左右，需要每个月移种一次。

2、液体石蜡覆盖保藏法

（1）将液体石蜡装在三角烧瓶中，并使用棉塞塞好，用牛皮纸进行包扎，然后在0.1MPa，121.3℃的环境下灭菌30分钟左右，接着将其放置在40℃的温箱之中，将水汽蒸发掉。

（2）将需要保藏的菌种，用适合的斜面培养基进行培养，得到健壮的孢子或者是菌体。

（3）使用灭菌过的吸管将液体石蜡吸出，注入斜面上，用量为高出斜面顶端1cm左右为宜。

（4）将试管直立，放置在低温或者是室温之下进行保存。

（5）霉菌、放线菌、芽孢细菌可以保藏2年以上不死，酵母菌可以保藏1-2年，一般无芽孢细菌可以保藏1年，脑膜炎球菌可以保藏3个月左右（37℃环境下）。

3、沙土保藏法

（1）准备好河沙，加入10%稀盐酸，然后加热煮沸30分钟左右，将里面的有机质去掉，然后将酸水倒掉，用自来冲洗至ph为中性，接着烘干，过筛（40目筛子），去掉粗颗粒。

（2）准备好非耕作层的不含腐植质的瘦黄土或红土，浸泡洗涤数次，直至ph为中性，然后烘干，碾碎，过筛（100目筛子），去掉粗颗粒。

（3）将沙和土按照2：1的比例混合，装入试管或者是安瓿管中，塞好棉塞，在1212℃的环境下灭菌30分钟左右。

（4）将菌种在斜面培养基中培养，得到健壮的菌体，然后向斜面培养物中注入3-5ml无菌水，洗下细胞或孢子制成菌悬液。

（5）使用灭菌过的吸管吸取菌悬液，然后均匀滴入沙土管中（0.2-0.5ml/管）。如果是放线菌或霉菌，可以直接挑取孢子拌入沙土管中。

（6）真空抽去沙土管中的水分。

（7）将沙土管用火焰熔封，然后存放在低温(4-6℃)干燥处保藏，或者是将沙土管用牛皮纸或塑料纸包好，放置在干燥器内保存。保存期间，每隔6个月左右检查一次菌种存活性。