女朋友对男朋友说谢谢并不一定代表疏远。回复谢谢的含义取决于具体情境和语境。下面是一些可能的解释：

1、女朋友真的感激男朋友的帮助或关心，回复谢谢是表达她的感激之情。

2、女朋友认为男朋友的行为是应该的，所以回复谢谢是一种礼貌的表达，表示她注意到了他的付出。

3、女朋友可能觉得男朋友的帮助或关心有些过分，回复谢谢是一种委婉的方式，表达她的保留或犹豫。

4、女朋友可能对男朋友的行为感到困惑，不确定如何回应，所以只能回复一个谢谢。

总之，女朋友回复谢谢并不一定代表疏远，但也可能暗示着她对男朋友的行为有所保留或犹豫。在这种情况下，最好与女朋友进行开放和诚实的沟通，了解她的感受和想法。尊重她的决定，并努力维持健康和互相理解的关系。