天邦食品将总部从上海搬到南京是因为南京作为江苏省的省会城市，拥有较为完善的行政、商业和交通基础设施，有利于公司的业务发展和日常运营。同时，南京的地理位置和资源优势也有助于天邦食品在长三角地区的战略布局和市场拓展。