针对于土地确权错误，一般分两种情况，第一种情况对于土地的权属、土地经营权等权属存在争议。第二种情况权属清晰，仅对确权的面积位置有错误，出现错别字也包含在第二种情况之内。
对于土地的权属、土地经营权等权属存在争议。
实践中，针对于集体土地使用权产生的争议，在土地确权时争议的一方可能基于“合理的权利外观”取得了权利证书，也可能基于争议的一方在公示期间未在村组居住生活无法提出异议，从而导致另一方“合法的”取得权利证书。
（1）协商处理，争议发生后先由当事人之间协商解决。所谓协商，就是指各方在自愿互谅的基础上，依照法律的规定，直接进行磋商，自行解决争议。如果争议各方达成一致意见则协商成功。如果协商不成或者协商达成了协议而另一方又反悔，不履行协议，他方可以按照申请人民政府处理。（2）政府处理。当事人协商不成的由人民政府处理。两个个人或者个人与单位之间的争议，由乡级人民政府处理；两个单位之间的争议由县级人民政府处理。人民政府裁决申请后，一般是对当事人先进行调解，调解不成的进行行政裁决。行政裁决须以人民政府的名义并出具处理决定书，该决定书加盖人民政府处理土地所有权和使用权争议的专用章。
（3）提起诉讼。当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定之日起30日内，向人民法院起诉。
