只因为这一道命令，让台湾人民在接下来的五十年内，纷纷站起来抵抗，后来据统计在这五十年里，因抗日保台而牺牲的台湾人民居然有六十五万之多； 而在日本公布这道命令之前，日本的驻台湾总督桦山资纪再一次请求增兵，这次是一个师团，也就意味着要在日本派出五万人，台湾的日军将增加到七万五千人；这是日本常规军队的三分之二，而内阁很快就同意了,这对于台湾仅有台南一座孤城来说，是一个噩耗；刘永福的黑旗军仅有两千人，且建制不全，而义军和山民仅能组织起来的力量不过万余人，台南保卫战将是一场恶战。 这时日本的彰仁亲王去看望打败北洋水师的海军中将伊东祐亨，自从甲午战争过后，伊东祐亨便被召回了国，伊东祐亨此时正在摆弄着他的军舰模型；原来日本内阁认为桦山资纪的陆军不足以占领整个台湾，想让伊东祐亨出动军舰与陆军共计五万人彻底占领台湾。 大清的朝廷此时正为日本的两亿三千万两银子发愁，最终户部筹得白银8000万两，剩下的便只好请李鸿章出马；李鸿章找俄法借款4亿法郎，也就是白银一亿两；后来又找英德借了两次款，共计四千八百万两白银。而令孙毓汶没有想到的是，李鸿章根本就没有提赎回台湾的事。 于是孙毓汶便找俄法德公使来总理衙门，可到了约定的日子他们却没来，反而没有邀请的日本公使却来了；随后日本公使抗议大清援助台湾物资和人员，孙毓汶当然公开声明绝对没有的； 而慈禧听说俄法德公使全部甩手了，日本又以武力要挟，慈禧便下令，不许让沿海各省支援台湾一枪一弹，一卒一兵，一粮一饷；很快两江总督张之洞收到朝廷的旨意，暂停了对台湾的支援，而在此之前，沿海以张之洞支援最多，沿海督抚一看，张之洞都停了，便纷纷也暂停支援台湾，这让台南彻底沦为一座孤城。而日军随着海陆军五万人的增援军抵达台湾，很快就部署了更猛烈的攻势，形势岌岌可危！
