“天下第一家”孔氏家族在绵延二千多年的历史中曾出现过两次分立南北宗，一次几乎灭绝的危险。第一次分立南北宗，发生在两晋之际。孔子第五十二代孙孔懿跟随晋元帝南迁，并居于会稽。从此，孔氏分立南北宗。 第二次分立南北宗，发生在两宋之际，这次是孔子的四十八代孙衍圣公孔端友背着孔子与亓官夫人的楷木像跟随宋高宗南迁，并居住于衢州。孔端友去世后，其子孔玠继承“衍圣公”封号，与此同时，孔端操留在曲阜，被金朝视为孔门正宗。孔端操的儿子孔璠被金熙宗封为“衍圣公”。孔氏再次分立南北宗。 孔氏家族曾经历过一次几乎被灭宗的危险。五代后梁乾化三年，孔庙的洒扫户孔末野心勃勃，欲将曲阜孔子后裔消灭殆尽。然而，天不灭孔子后裔。孔子四十三代孙幼小的孔仁玉因藏匿于外祖父家而幸免于难。此事件史称“孔末之乱”。