慢性疾病证明报销比例如下：1、具体各地的规定并不是完全一致的，可能略有差别。2、一般，常见慢性病患者在慢性病定点医疗机构就诊，年度起付线300元，可补偿费用的补偿比例为55%。3、单一病种的年度补偿总额上限为2000元，每增加一种慢性病病种提高800元，最高不超过3600元，实行即时结报。慢性病报销流程如下：1、由患者本人向社保中心提出申请，填写正式的申请表。2、将二级以上医院的诊断证明材料上报社保中心，经专家委员会鉴定审核后，办理慢性病证历。专家委员会对慢性病的鉴定一个季度举办一次，鉴定所需费用由个人或单位承担。3、患者在指定的医院门诊部看病购药。4、在规定的时间内，到社保中心予以报销慢性病医疗费用，同时将《慢性病门诊医疗费用清单》连带处方、发票、慢性病证历、病历、各种检查报告单等一并存档。综上所述，慢性病由于是一种必须长期治疗的病，因此医保对于慢性病是有特别的规定的，首先要办理报销前，一定要提交鉴定报告，办理慢性病确认书，否则就无法谈报销了。【法律依据】：《中华人民共和国社会保险法》第三十条下列医疗费用不纳入基本医疗保险基金支付范围：（一）应当从工伤保险基金中支付的；（二）应当由第三人负担的；（三）应当由公共卫生负担的；（四）在境外就医的。医疗费用依法应当由第三人负担，第三人不支付或者无法确定第三人的，由基本医疗保险基金先行支付。基本医疗保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。