法律分析：

1、公司营业执照丢失补办的流程是：登报声明作废；提交申请材料；补领证照。

2、公司应提交的文件有：

(1)法定代表人签署的营业执照遗失补领申请报告。

(2)公司签署的《指定代表或者共同委托代理人的证明》及指定代表或委托代理人的身份证复印件；应标明具体委托事项、被委托人的权限、委托权限。

(3)刊登营业执照遗失并声明作废公告的报纸报样等。

法律依据：

《公司登记管理条例》第六十条营业执照遗失或者毁坏的，公司应当在公司登记机关指定的报刊上声明作废，申请补领。公司登记机关依法作出变更登记、注销登记、撤销变更登记决定，公司拒不缴回或者无法缴回营业执照的，由公司登记机关公告营业执照作废。