商铺40年产权到期了，可以办理续期手续，缴纳续期费用。住宅建设用地使用权期限届满的，自动续期，续期的费用根据当地的具体规定；非住宅建设用地的使用权期限届满的，有约定的按约定，无约定的按照法律或行政法规处理。商铺40年产权属于非住宅用地，不能自动续期。租赁期间届满，承租人继续使用租赁物，出租人没有提出异议的，原租赁合同继续有效，但租赁期限为不定期。

【本文关联的相关法律依据】

《中华人民共和国民法典》

第三百五十九条住宅建设用地使用权期限届满的，自动续期。续期费用的缴纳或者减免，依照法律、行政法规的规定办理。

非住宅建设用地使用权期限届满后的续期，依照法律规定办理。该土地上的房屋以及其他不动产的归属，有约定的，按照约定；没有约定或者约定不明确的，依照法律、行政法规的规定办理。