申请健康证明需要检查的主要是职工有无病毒性肝炎、疟疾、伤寒、活动性肺结核、皮肤病，一般需要进行内外科的常规检查、X光胸透等。完成体检后结果符合条件的，经卫生监督机构核实后，提供本人正面免冠彩色照片到所管辖的卫生局卫生监督所办理健康证明即可。
《中华人民共和国食品安全法》第四十五条食品生产经营者应当建立并执行从业人员健康管理制度。患有国务院卫生行政部门规定的有碍食品安全疾病的人员，不得从事接触直接入口食品的工作。从事接触直接入口食品工作的食品生产经营人员应当每年进行健康检查，取得健康证明后方可上岗工作。