办理建设工程监理合同备案的流程是：1、首先由总承包方向市政服务中心申请办理；2、再由总承包方递交已备案的施工总承包合同、全部分包合同文本、分包交易登记表等资料；3、工作人员根据资料受理并审核总承包方的资质，审核通过的，予以备案登记。【法律依据】《建筑法》第二十九条建筑工程总承包单位可以将承包工程中的部分工程发包给具有相应资质条件的分包单位；但是，除总承包合同中约定的分包外，必须经建设单位认可。施工总承包的，建筑工程主体结构的施工必须由总承包单位自行完成。建筑工程总承包单位按照总承包合同的约定对建设单位负责；分包单位按照分包合同的约定对总承包单位负责。总承包单位和分包单位就分包工程对建设单位承担连带责任。禁止总承包单位将工程分包给不具备相应资质条件的单位。禁止分包单位将其承包的工程再分包。