法律分析:

一般由由立据双方依据协议价格的万分之五的税率计征印花税。当公司有实际入资的资金，根据转让的金额，双方缴纳万分之五的印花税，当公司没有实际入资的资金，转让方、受让方都不用缴纳印花税。

法律依据:

《中华人民共和国印花税法》

第十一条已缴纳印花税的营业账簿，以后年度记载的实收资本（股本）、资本公积合计金额比已缴纳印花税的实收资本（股本）、资本公积合计金额增加的，按照增加部分计算应纳税额。

第十五条印花税的纳税义务发生时间为纳税人书立应税凭证或者完成证券交易的当日。

证券交易印花税扣缴义务发生时间为证券交易完成的当日。