公司全勤奖在请年假后就没有了，这种情况不合理，但是合法。合理是因为年假属于国家规定的员工权益，每个企业员工在满足年假条件都可以享受年假的待遇。休了年休假是不能扣全勤奖的。劳动者在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入，休假期间也视为出勤，因此不能扣劳动者的全勤奖。但是如果劳动者休假当月另外有迟到，早退等现象的，则可以按规定来扣。对于职工休年假是否应该扣全勤奖，法律并没有明确规定。有两种看法，一种是认为要看公司的额规章制度，一种认为不能扣，因为年休假是带薪的，是国家规定劳动者应当享受的，他的性质跟法定节假日相同。对于职工休年假是否应该扣全勤奖，法律并没有明确规定。有两种看法，一种是认为要看公司的额规章制度，一种认为不能扣，因为年休假是带薪的，是国家规定劳动者应当享受的，他的性质跟法定节假日相同。对于职工休年假是否应该扣全勤奖，法律并没有明确规定。有两种看法，一种是认为要看公司的额规章制度，一种认为不能扣，因为年休假是带薪的，是国家规定劳动者应当享受的，他的性质跟法定节假日相同。

法律依据：

《职工带薪年休假条例》

第三条职工累计工作已满1年不满10年的，年休假5天；已满10年不满20年的，年休假10天；已满20年的，年休假15天。国家法定休假日、休息日不计入年休假的假期。