结膜炎症性疾病根据病情及病程，可分为急性、亚急性和慢性三类；根据病因又可分为细菌性、病毒性、衣原体性、真菌性和变态反应性等；根据结膜的病变特点，可分为急性滤泡性结膜炎、慢性滤泡性结膜炎、膜性及假膜性结膜炎等。

首先根据患者的发病过程和临床表现可有一初步判断，如感染性结膜炎通常是双眼发病，并可累及家人；大多数急性病毒性结膜炎最先是一眼发病，而后另眼发病；沙眼的病变以上睑为主；而病毒所致的急性滤泡性结膜炎则是以下睑为主；细菌性结膜炎的卡他症状更为显著；淋球菌所致的炎症则出现大量的脓性分泌物；这些病变特点皆有助于诊断。

区分上面两种类型的结膜炎，有两种方法，第一种是临床经验，一般细菌性的结膜炎，通常伴随有一些黄白色的分泌物，病毒性的结膜炎分泌物一般为水样，第二个可以做培养，取眼部分泌物做细菌培养，细菌性结膜炎通常可以培养出细菌，而病毒性结膜炎则不会。