法律分析：被告人对赔偿标准有异议，应当在诉讼中提出，并在法庭上进行辩论。赔偿标准的确定应当遵循公平合理、依法依规的原则。

法律依据：

1.《民法典》第一百八十一条：损害赔偿的标准，应当根据造成损害的性质、情节和后果，综合考虑受害人和侵权人的情况确定。

2.《中华人民共和国侵权责任法》第十四条：因侵权行为造成损害的赔偿，应当根据损害的程度和损失的情况，以及侵权人的过错程度和故意或者重大过失程度等因素确定。

3.《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的解释》第二十条：当事人对于利率、违约金、诉讼费、保全费、案件受理费、律师费、财产保险费、仲裁费、公证费以及其他合理费用的支付标准有异议的，可以在诉讼中提出，由人民法院依法认定。

因此，被告人在对赔偿标准有异议的情况下，可以在诉讼中提出，并由法院根据相关法律规定综合考虑，确定公平合理的赔偿标准。