纸质发票和电子发票的区别如下：

1、呈现方式不同：

纸质发票是以纸质方式呈现的，电子发票是以数字方式呈现的；

2、保存的方式不同：

纸质发票是需要好好保存纸质发票，电子发票只要保存好电子档就可以了，必要的时候再进行打印，不会因为丢失纸质的找不到备份；

3、开票成本不同：

与传统纸质发票相比，电子发票管理系统可以在线开票，节省发票工本费、税控机成本以及相关人力成本；

4、发票联次不同：

纸版专票有三联版和六联版，基本联次为三联：第一联为记账联，是销售方记账凭证；第二联为抵扣联，是购买方的扣税凭证；第三联为发票联，是购买方的记账凭证。

电子专票只有一联，销售方和购买方都一样。

5、丢失的处理方法不同：

纸版专票丢失了，视不同情况采取不同的措施，两联均丢，要取得开票方加盖其发票专用章的记账联；丢了其中一联（发票联或抵扣联），用另一联的复印件替代。

电子专票丢了或者误删了，可以根据发票代码、发票号码、开票日期、开具金额（不含税）等信息，在全国增值税发票查验平台查验通过后，下载电子专票。如不掌握相关信息，也可以向开票方重新索取原电子专票。

法律依据：《中华人民共和国发票管理办法实施细则》第三条

发票的基本联次包括存根联、发票联、记账联。存根联由收款方或开票方留存备查；发票联由付款方或受票方作为付款原始凭证；记账联由收款方或开票方作为记账原始凭证。

省以上税务机关可根据发票管理情况以及纳税人经营业务需要，增减除发票联以外的其他联次，并确定其用途。第七条全国统一的发票防伪措施由国家税务总局确定，省税务局可以根据需要增加本地区的发票防伪措施，并向国家税务总局备案。

发票防伪专用品应当按照规定专库保管，不得丢失。次品、废品应当在税务机关监督下集中销毁。第十条监制发票的税务机关根据需要下达发票印制通知书，被指定的印制企业必须按照要求印制。

发票印制通知书应当载明印制发票企业名称、用票单位名称、发票名称、发票代码、种类、联次、规格、印色、印制数量、起止号码、交货时间、地点等内容。