房屋他项权证丢了，注销抵押登记需先前往办理抵押贷款的银行，申请出具证明已经还款完毕的证明。然后携带证明等相关材料到房地产管理部门办理注销登记。《城市房地产抵押管理办法》第三十四条第一款规定，以依法取得的房屋所有权证书的房地产抵押的，登记机关应当在原《房屋所有权证》上作他项权利记载后，由抵押人收执。并向抵押权人颁发《房屋他项权证》。第三十五条第一款规定，抵押合同发生变更或者抵押关系终止时，抵押当事人应当在变更或者终止之日起15日内，到原登记机关办理变更或者注销抵押登记。

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《城市房地产抵押管理办法》第三十四条第一款以依法取得的房屋所有权证书的房地产抵押的，登记机关应当在原《房屋所有权证》上作他项权利记载后，由抵押人收执。并向抵押权人颁发《房屋他项权证》。《城市房地产抵押管理办法》第三十五条第一款抵押合同发生变更或者抵押关系终止时，抵押当事人应当在变更或者终止之日起15日内，到原登记机关办理变更或者注销抵押登记。