5000不扣个税。5000元工资是不需要缴纳个人所得税，其刚好属于个税的起征数额。计算公式，应纳税所得额=工资收入金额－各项社会保险费－起征点（5000元）。应纳税额=应纳税所得额x税率－速算扣除数。根据公式，工资5000应该交的税=（5000-5000）*3%-0=0元。

《中华人民共和国个人所得税法》第三条个人所得税的税率：（一）综合所得，适用百分之三至百分之四十五的超额累进税率（税率表附后）；（二）经营所得，适用百分之五至百分之三十五的超额累进税率（税率表附后）；利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，适用比例税率，税率为百分之二十。