律师分析:

依法办理的购回迁房协议公证是有效的。

【法律依据】:

《中华人民共和国公证法》 第二条 公证是公证机构根据自然人、法人或者其他组织的申请，依照法定程序对民事法律行为、有法律意义的事实和文书的真实性、合法性予以证明的活动。