注册公司在工商行政管理机关办理。依据我国公司法的规定，一般情况下，设立公司，需要依法向公司登记机关申请设立登记。公司登记机关一般属于工商行政管理机关，下级公司登记机关在上级公司登记机关的领导下，开展公司登记工作。公司登记机关需要依法履行职责，不可以受非法干预。

【本文关联的相关法律依据】

《中华人民共和国公司法》

第六条设立公司，应当依法向公司登记机关申请设立登记。符合本法规定的设立条件的，由公司登记机关分别登记为有限责任公司或者股份有限公司；不符合本法规定的设立条件的，不得登记为有限责任公司或者股份有限公司。法律、行政法规规定设立公司必须报经批准的，应当在公司登记前依法办理批准手续。公众可以向公司登记机关申请查询公司登记事项，公司登记机关应当提供查询服务。