法律分析：新生儿医疗事故的处理办法有协商、调解以及诉讼。发生医疗事故后，首先医患双方可以进行协商调解，达成协议，处理结束。如果双方协商不成，医患任何一方均可向主管卫生行政部门提出处理请求。请求进行医学鉴定，根据鉴定结果，协调双方承担相应责任。达成调解协议的，处理结束。如果不服协调，可以向法院提起诉讼。
法律依据：《医疗事故处理条例》
第三十七条发生医疗事故争议，当事人申请卫生行政部门处理的，应当提出书面申请。申请书应当载明申请人的基本情况、有关事实、具体请求及理由等。
当事人自知道或者应当知道其身体健康受到损害之日起1年内，可以向卫生行政部门提出医疗事故争议处理申请。