公司清退员工时如何补偿需按照实际情况判断，具体内容如下：1、公司合法辞退员工，应当支付经济补偿金，支付经济补偿金的标准是按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。其中，工作年限六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资；2、公司违法辞退员工的，应当支付经济赔偿金。支付经济赔偿金的标准是经济补偿金的两倍，即按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付两个月工资的标准向劳动者支付。公司合法解除劳动合同的情形如下：1、劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的；2、劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的；3、劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行，经用人单位与劳动者协商，未能就变更劳动合同内容达成协议的；4、经济性裁员。法律依据：《中华人民共和国劳动法》第四十六条工资分配应当遵循按劳分配原则，实行同工同酬。工资水平在经济发展的基础上逐步提高。国家对工资总量实行宏观调控。第四十七条用人单位根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平。