军人婚内出轨但不同意离婚可以选择起诉离婚。现役军人的配偶要求离婚，须得军人同意，但军人一方有重大过错的除外。军人婚内出轨，无须军人同意，军人的配偶是可以提出离婚的。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》

第一千零七十九条夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：

（一）重婚或者与他人同居；

（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；

（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；

（四）因感情不和分居满二年；

（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。

一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。

第一千零八十一条现役军人的配偶要求离婚，应当征得军人同意，但是军人一方有重大过错的除外。