已有事实婚姻未登记，分居后财产分配要根据实际情况而定，具体如下：

1、已有事实婚姻未登记不属于法定夫妻，同居期间的财产按共有关系处置，按约定分配财产；

2、没有约定或者约定不明确的，按照出资额分配；

3、出资额不确定的视为平均分配。

根据相关法律规定，共有人对共有房地产或者动产的份额没有约定或者约定不明确的，按照出资额确定；出资额不能确定的，视为等额享有。

【本文关联的相关法律依据】

《中华人民共和国民法典》

第三百零九条按份共有人对共有的不动产或者动产享有的份额，没有约定或者约定不明确的，按照出资额确定；不能确定出资额的，视为等额享有。