日本科学家对鸡进行研究和试验，第一次发现和证实了：鸡的“生物钟”长在鸡的松果体细胞里。松果体在大脑和小脑之间，是一个松果形状的小内分泌器官。一到黑夜，它就分泌出一种叫黑色紧张素的激素，来抑制鸡的活动。如果给鸡埋上装有黑色紧张素的胶囊，鸡就入睡了。根据科学研究发现，在公鸡的大脑与小脑之间，有一个内分泌器官叫松果腺，“生物钟”就生长在这里。由于松果腺一到晚上就能分泌一种黑色紧张素，使雄鸡能够记忆明和暗的规律，进行周期性的鸣叫活动。

由于鸡的生物钟，就如同人的生物钟一样，受到夜晚（黑暗中）时分泌的褪黑素影响。同时，公鸡打鸣和鸡的雄激素也有关，阉鸡和母鸡不会打鸣正是由于它们没有雄激素，如果给母鸡注射雄激素，母鸡也会开始打鸣。

经过了漫长的进化，报晓的本能已经深深刻在了公鸡的基因里。现在，有些公鸡在黑暗的环境中也会在清晨的时候打鸣报晓。公鸡报晓也有“求偶”的因素，通过鸣叫的声音吸引母鸡。总而言之，公鸡报晓是一种有很多含义的行为。