广东财经大学佛山三水校区创办于1999年12月，2000年开始招生。校区位于广佛肇绿色发展的新坐标原点即佛山市三水区云东海旅游区，该区域森林覆盖率达百分之八十，陆地水体比例约为7比3，山水相连、环境优美，被称为佛山现代“新西湖”，是学生读书、思考、创造的乐园，是教师教书、研究、创新的理想之所。

校区实行延伸管理与属地管理相结合的管理体制，即相应的职能业务由学校相关职能部门实施延伸管理，其他日常行政管理业务及其所涉及的人、财、物由校区管委会进行属地管理。教学上实行“2+2”的运行模式，即学生一、二年级在佛山校区学习，三、四年级回广州校区学习。