有赔偿的，每工作一年赔偿一个月工资，员工已经入职，在公司的年度体检中检查不合格的，要按照国家医疗期的规定执行，医疗期满不能从事原工作，也不能从事另行安排工作的，才可以辞退，并且要依法支付经济补偿金。

公司体检的意义：1、有利于晋升机制建设按照员工的身体健康状况考量公司员工培养及晋升计划。2、可以提高员工工作效率做体检可以减少因生病缺勤等产生的工作不协调影响工作进度，对员工健康关心，提高员工企业归属感和工作热情，提高工作效率。3、能够减少人力资源损失通过健康干预降低发病率，减少病假和健康事假，降低病假工时和事假工时，保证企业的正常运转。4、可有效的控制和防患公司员工职业病通过体检，及时发现员工及特殊工种员工的职业病，这样就可以进行有效的控制和防患。5、可减少企业医疗保健相关支出该服务对企业医疗保健相关支出做出了系统综合考虑，统筹安排，降低企业总的医疗支出。6、能够体现公司对员工的人性关怀提供各种医疗保健咨询和服务，使员工享有专业的个性化健康指导。可以通过健康干预措施，降低员工发病率和亚健康状态，显示企业对员工的真正关心;定期的体检，则可作为鼓励员工的手段，将公司对员工的关怀落到实处。7、合理进行人员岗位安排通过体检报告情况合理安排人员岗位，确定不同类型员工是否符合所在岗位工作要求，可按照身体状况进行人员岗位调配，有助于提高工作效率，避免因为身体问题影响工作进度，有助于提高工作质量。

法律依据：《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算;不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。