在南京南站内进行换乘的方法有以下几种：

1. 地铁：南京南站是地铁1号线和3号线的交汇站。如果需要换乘地铁，可以先从站台出来，沿着指示牌前往地铁换乘层，然后根据需要换乘的线路选择相应的站台，再次进入地铁系统进行换乘。

2. 高铁/动车：南京南站是高铁和动车的始发站或经停站。如果需要换乘不同的高铁或动车，可以先到达所需的候车室，等候下一班列车即可。

3. 公交车：南京南站附近有多条公交线路可以前往不同的地点。在站内换乘公交车，可以先找到南京南站的公交场站，根据需要乘坐的线路选择相应的公交车，然后上车前往目的地。

需要注意的是，南京南站内换乘时要留意站内的指示牌或问询站内工作人员，以确保选择正确的换乘方式和线路。