论文工作记录和指导日志的区别是功能和使用方法不同。论文工作记录主要用于记录研究生在论文实验和论文写作过程中的具体工作内容，包括实验数据、参考文献、文献阅读笔记、分析方案和实验结果等。记录的内容比较详细，旨在帮助研究生在撰写论文时回顾整个研究过程，归纳总结实验结果和分析。论文工作记录的形式多样，可以是手写笔记、电子文档或是实验记录单等。指导日志则是指导教师对研究生进行指导和评价的记录。主要包括指导教师提供的研究方向、主题和方法，研究生在指导下的工作计划和进度记录，以及研究生在指导下的疑问和问题等。指导日志的主要目的是帮助指导教师记录指导内容和研究生的进展情况，便于及时跟进和调整研究方向和计划。指导日志一般由指导教师书写，可以是纸质或电子文档形式。