鸡蛋爆炸的原因，类似于水的“爆沸”原理。鸡蛋内部过热，压力过大，受到外界干扰，压力释放，于是就会发生爆炸；
微波炉主要加热水分，这些水分子随机排列，正负电子相互抵消。微波炉发出的电磁波相当于一种旋转的电场。电磁波每秒钟要转二十多亿圈，水分子高速旋转，摩擦生热，温度在短时间内会急剧升高。一旦微波停止，旋转电场消失，水分子也就静止下来。这个过程中，水分子本身并没有被微波改变。
不仅是水，其它极性分子也都可以被微波加热。通常的食物中都含有水和其它极性分子，所以在微波作用下可以被迅速加热，如果温度过高，就会发生爆炸。