尚书是从一品，巡抚一般是二品，所以尚书职位高。

尚书，是中国封建时代的政府高官名称，相当于现在各国家部委的部长。在清朝，六部和理藩院等部门的主官称为尚书。

巡抚是中国明清时地方军政大员之一，又称抚台。巡视各地的军政、民政大臣。清代巡抚主管一省军政、民政。以巡行天下，抚军按民而名。清代，地方大员的品级为：总督，加兵部尚书衔，兼都察院右都御史衔，从一品，加兵部右侍郎兼都察院右副都御史衔，正二品；巡抚，从二品，加兵部侍郎衔，正二品。总督官衔略高于巡抚，前期督权远过于抚，如两江总督按例兼辖江苏、安徽、江西三省，而末期安徽、江西两抚即不再听命于总督。北周与唐初均有派官至各地巡抚之事，系临时差遣，巡抚亦未成为官名。