南苏丹的经济支柱是石油出口收益，但是南苏丹工业基础薄弱，经济十分落后，炼油需使用北苏丹的工业城市。南苏丹独立后，根据和平协议，南苏丹每年分得南方油区所产石油收入的50%。苏南方石油储量丰富，并在农、林、渔、畜牧等产业方面具有较大潜力。南苏丹的自然资源相当丰富，拥有全苏丹85%以上的石油产能，以及铁、铜、铬、铅锌、钨、云母和金银等矿藏，但除石油外，大多数矿藏资源尚待开发；拥有原苏丹大部分原始森林资源，赤道大区是柚木、桃花心木和各种热带硬木的著名产区；水源丰沛稳定的白尼罗河和众多支流从这里流过，水力资源丰富，水电发展潜力巨大；大部分人口仍从事农业，棉花、花生、小麦、小米、木薯和各种热带水果是主要作物，此外，这里是著名的阿拉伯树胶产地。