1921年,江西公立医学专门学校成立,为南昌大学医学院前身,何焕奎任首任校长。
1952年,教育部根据以“培养工业建设和师资为重点,发展专门学院,整顿和加强综合性大学”的方针,开始大规模的院系调整。
1958年,江西工学院和江西大学成立,1962年江西师院生物系并入江西大学。
1985年江西工学院更名为江西工业大学,江西大学和江西共青垦殖场联合创办了江西大学共青学院。
1993年江西大学与江西工业大学合并组建成新的南昌大学,同年成为江西省第一个博士授予单位。
1997年,南昌大学正式列入国家“211”工程重点建设大学。
2002年12月29日,南昌大学前湖校区奠基。
2005年,南昌大学与江西医学院正式合并组建新南昌大学。
2008年10月6日,南昌大学太阳能光伏学院成立,是中国第一所在大学设立的光伏学院。
2017年9月,入选国家首批“双一流”世界一流学科建设高校。