1、国航分公司有：西南分公司成都)、澳门航空、重庆分公司、内蒙古分公司呼和浩特)、山东航空、贵州分公司等。

2、西南分公司成都)。中国国际航空公司西南分公司前身是成立于1987年10月15日的中国西南航空公司，是中国民航第一家按照政企分开改革原则组建起来的国家骨干航空公司。2002年10月30日，中国西南航空公司与中国国际航空公司重组，改组后成为中国国际航空公司西南分公司。正式启用中国国际航空公司西南分公司”的名称，该公司总部依旧设立在成都。

3、贵州分公司。中国国际航空股份有限公司贵州分公司（以下简称国航贵州公司），成立于2006年06月19日，运营基地为贵阳市龙洞堡国际机场。主营国际、国内定期和不定期航空客、货、邮和行李运输业务；国内、国际公务飞行业务；飞机执管业务；航空器维修；航空公司间业务代理；与主管业务有关的地面服务和航空快递（信件和信件性质的物品除外）；机上免税品。

4、澳门航空。澳门航空（AirMacau）是一家以中华人民共和国澳门特别行政区为基地的航空公司，澳门航空成立于1994年9月13日，于1995年11月9日开始正式作商业飞行。澳门航空是基地位于澳门的地区性国际航空公司，提供到中国台湾、中国大陆、欧洲、东南亚与东亚的航线。主要枢纽基地是澳门国际机场。

5、内蒙古分公司。中国国际航空内蒙古有限公司简称内蒙古航空。2012年8月23日，中国国际航空内蒙古有限公司揭牌成立，标志着内蒙古自治区首家本土航空公司正式成立。新成立的中国国际航空内蒙古有限公司注册资本为10亿元，是一家由中国国际航空股份有限公司控股、内蒙古国有资产运营有限公司参股的现代化航空公司。其中中国国际航空占注册资本80%，内蒙古国有资产运营有限公司占20%。

6、山东航空。山东航空成立于1994年，现拥有波音飞机120余架，在济南、青岛、烟台、厦门、重庆、北京等地设有分公司和飞行基地，经营国际、国内航线200余条。