1、浸泡。将买回来的通货菩提放入水盆中，水差不多2节手指那么高。春夏用开水浸泡半个小时。秋冬用三十摄氏度的水浸泡两个多小时，软化金刚菩提子表面的果肉。

2、去除坏子。浸泡后，把浮起来的坏子（密度过低或空心）捡出来丢弃。这些坏子没有任何的盘玩价值，沉到水底的是好子。

3、粗刷。将金刚菩提子拉平，用细毛钢丝刷（如下图），垂直角度，进行粗刷；确保珠子转动起来，使每个角度都能刷到。

4、冲洗。粗刷完后再把金刚菩提子放到水中，冲刷剩余残渣，这样就完成了初步清理。

5、密封。将金刚菩提子初步清理以后，用密封袋或者容器把金刚密封起来，密封是为了继续软化金刚表面残留的果肉。

6、细刷。用猪毛刷子仔细的清理金刚菩提子，需要重复多次，直到表面不再返碱。每一次细刷以后，需要让金刚菩提子阴干阴干，阳光直射或者风吹导致开裂破损。

7、抛光。清理干净并晾干后，可以用猪鬃刷子进行最后的抛光。