原子很空”其实是个不准确的说法。这个说法的来源是卢瑟福散射实验，这个实验用 粒子轰击金箔，发现会对粒子造成散射的截面只占整个原子截面非常小的一部分，进而推出结论：原子的绝大部分质量集中在直径只有整个原子直径的千分之几的区域内（ 量级），原子内部实际上非常空旷。但是注意：这个结论只适用于 粒子轰击的实验。 粒子就是氦核，是一种很重的粒子，所以只在和同样很重的原子核碰撞时，才有明显的散射效应。然而一般可见光/红外光/紫外光/X射线等等，实际上主要是和原子中的电子产生相互作用的。电子的波函数弥散于整个原子内部（ 量级），所以从这个角度上说，原子又一点也不空。至于光能不能穿越原子，要具体看光子的能量以及原子之间结合的方式，比如可见光能穿透玻璃，却穿不透金属，就是因为玻璃和金属中原子的结合方式不同。