肚脐发臭的原因是因为肚脐有炎症，出现细菌感染或者肚脐有脓肿，有脓液流出来的时候一般会有臭味。常规感染的细菌以金黄色葡萄球菌为主，有时也会有溶血性链球菌等其他的细菌。

肚脐、脐，俗称肚脐眼，医学上称之为神阙穴，从本质上来说是胎儿出生后，脐带脱落后留下的疤痕。肚脐位于髂前上棘水平的腹部正中线上，直径约为1.0至2.0厘米。它通常可以是一个小凹陷或是一个小突出。肚脐下面的腹部肌肉形成一个凹陷。肚脐的细小通常带来一定的组织弱化(structuralweakness)并使它易受脐疝气的影响。肚脐是柔弱的部分，日常要注意保护，不可受冷或手抠等。