虽然员工违反了规章制度及国家的法律法规，但员工事发后积极地清退了钱款且已经受到了法律的制裁，而工资是劳动者在工作期间的劳动所得，如果公司的员工确实在公司工作了，那么工资是需要进行发放的。

【法律依据】

《刑法》第二百七十一条公司、企业或者其他单位的人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，处5年以下有期徒刑或者拘役;数额巨大的，处5年以上的有期徒刑，可以并处没收财产。

国有公司、企业或者其他国有单位中从事公务的人员和国有公司、企业或者其他国有单位委派到非国有公司、企业以及其他单位从事公务的人员有前款行为的，依照本法第三百八十二条、第三百八十三条的规定定罪处罚。