在《口袋妖怪·漆黑的魅影》游戏中，凤王在石之洞窟的大吾洞中进行捕捉，由于凤王非常稀有，所以捕捉概率只有百分之五。具体的剧情如下：

1、在执行捕捉凤王的任务时，首先需要打败枯叶市电系道馆中的所有妖怪，打完以后可以获得圣安努号的船票。

2、根据地图上的提示，按照路线登上圣安努号轮船，圣安努号轮船会将玩家带到石之洞窟。

3、在石之洞窟的入口处首先打败守护关卡的蛟龙，然后即可进入石之洞窟。

4、然后在石之洞窟中找到大吾洞，进入大吾洞后使用喷雾剂可以提高遇见凤王的概率。

5、若遇到凤王，玩家在与凤王经过8个回合的相互攻击后即可将其收服；若没有遇见凤王，可将大吾洞中的宝珠收走，宝珠会使玩家的攻击力增加百分之十。