1、细菌侵染，如青枯病。该病多从枝条顶端叶片开始萎蔫，伴随整株叶片同时萎蔫青枯，病程较短。病茎外表症状不明显，纵剖茎部维管束变为褐色，横切面保湿可见乳白色粘液溢出。

2、为真菌病害，主要有枯萎病、疫病和菌核病3种。枯萎病发病初期下部叶片大量脱落，与地面接触的茎基部皮层呈水渍状腐烂，地上部茎叶迅速凋萎。疫病在辣椒整个生育期均可发生，以坐果后最易受害。成株期受害时，病部形成长条形斑，病健交界处明显，病斑凹陷或稍缢缩，病株叶片萎蔫脱叶致死亡。菌核病为害茎部或枝叉处，湿度大时，病部长出白色菌丝体，后期可长出黑色鼠粪状菌核，最后植株枯死。青枯病和枯萎病发生的比例很小，但青枯病是细菌性病害，不仅传播快，而且病程短、死得快，经常是毁灭性灾害。