目前在人口与健康领域应用最广的模式生物包括：噬菌体、大肠杆菌、酿酒酵母、秀丽隐杆线虫、海胆、果蝇、斑马鱼、爪蟾和小鼠，在植物学研究中比较常用的有：拟南芥、水稻等，常见的模式生物有果蝇、小鼠、拟南芥、斑马鱼、大肠杆菌、酵母、水稻、秀丽线虫等。