吴茱萸要煮20-30分钟才没毒，吴茱萸蒸溜液、煎剂和冲剂过滤后，分别给正常兔、正常犬和实验性肾性高血压犬进行静脉注射，均有明显的降压作用，而且持续时间长，一般长达3小时以上；煎剂给犬灌胃降压幅度较静脉注射小。吴茱萸的降压作用主要是使外周血管扩张而减低了外周血管的阻力，且与组胺释放有关。

吴茱萸中所含的吴茱萸苦素为苦味质，有苦味健胃作用，其所含的挥发油又具有芳香健胃作用。吴茱萸的甲醇提取物，有抗大鼠水浸应激性溃疡的作用；水煎剂还具有抗盐酸性胃溃疡和消炎痛加乙醇性胃溃疡作用，对水浸应激性和结扎幽门性溃疡有抑制形成的倾向.吴茱萸对离体小肠活动有双向作用，低浓度时兴奋，高浓度时抑制自发收缩活动，既能拮抗烟碱、毒扁豆碱、乙酰胆碱、组胺、氯化钡、酚妥拉明、利血平对离体小肠的兴奋作用；亦能对抗六烃季胺、阿托品和肾上腺素对离体小肠的抑制作用，但不能拮抗苯海拉明、罂粟碱、异搏定、美散痛对离体兔小肠的抑制作用。