橘子中有虫子主要是被柑桔大实蝇侵入。

柑桔大实蝇每年发生一代。以成虫产卵于果实中进行为害，常温下，2到4天即可孵化，卵孵化为1龄幼虫之后，幼虫由果皮钻进果实内部取食，待发育到2龄幼虫、3龄老熟幼虫后，即从危害果实内钻出进入沙土内化蛹，钻入沙土约为5到10厘米深，直至翌年四月气候回暖，蛹从土壤中羽化为成虫，成虫再次产卵，孵化为幼虫，幼虫化踊，蛹再羽化，生命周而复始，延续了物种的存在。

柑桔大实蝇属柑橘果品寄生虫，它不同于动物身体里面的寄生虫，不会造成人畜共患。同时，这种虫子具有很强隐蔽性，只有撕开桔肉，才能发现米粒长短的白色蛆虫，所以很容易误食，在食用的时候细心即可。

农业防治柑桔大实蝇主要有集中掩埋、火烧被幼虫姓害的黄果及掉落在树下的虫果，彻底消灭卵和幼虫；冬、春两季通过翻士灭踊，破坏蛹的越冬场所和影响成虫出土羽化。