苦瓜具有清热消暑、养对治疗痢疾、疮肿、中暑发热、痱子过多、结膜炎等病有一定的功效。苦瓜不仅有清心明目、清凉解渴、泻六经实火之功，还有益气生津、解除疲劳的作用;另外，还可用于防治中暑、痢疾、恶疮、赤眼疼痛等作用。

常吃苦瓜还能增强皮层活力，使皮肤变得细嫩健美。在燥热的夏天女性经常敷用冰过的苦瓜片，可以立即解除肌肤的干燥问题，并且苦瓜还能滋润白皙皮肤，镇静和保湿肌肤。中医学认为，脾胃温热内蕴上蒸，或肺经蕴热、或消化道功能紊乱、或冲任不调，上升凝滞于面部而成痤疮。夏季是青春痘的多发季节，苦瓜含丰富的维生素B1、维生素C及矿物质，长期食用，能保持精力旺盛，对治疗青春痘有很大益处。

苦瓜的新鲜汁液，含有苦瓜甙和类似胰岛素的物质，具有良好的降血糖作用，能使摄取脂肪和多糖减少。科学家从苦瓜中提取出口服类胰岛素药物。此药对糖尿病有显著疗效，还有明显的降血糖作用。

苦瓜蛋白质成分及大量维生素C能提高机体的免疫功能；苦瓜汁含有某种蛋白成分，能加强巨噬能力。临床上对淋巴肉瘤和白血病有效；从苦瓜籽中提炼出的胰蛋白酶抑制剂，可以抑制癌细胞所分泌出来的蛋白酶，阻止恶性肿瘤生长。苦瓜中所含的苦味素可抑制恶性肿瘤分泌蛋白质，防治癌细胞的生长和扩散。国外有实验发现，苦瓜能使人的舌、喉、口腔底部、鼻咽部癌的细胞生长受到抑制。

苦瓜的维生素C含量很高，具有预防坏血病、保护细胞膜、防止动脉粥样硬化、提高机体应激能力、保护心脏等作用。