天主教和基督教传入中国已经有几百年的历史了，虽然部分神职人员在中国干了一些坏事，但总的来说教会在中国的发展，尤其是清末民国时期，对我国近代教育和医疗事业做出了重要贡献。特别是在教育方面，教会在中国建立了许多著名的大学，部分大学在当时还是世界顶级大学。

1、燕京大学

燕京大学是20世纪初由四所美国及英国基督教教会联合在北京开办的大学，也是近代中国规模最大、质量最好、环境最优美的大学之一，创办于1919年，创始人司徒雷登长期担任燕大校长、校务长，他将燕大的校训确定为“因真理、得自由、以服务”。1928年春，燕京大学与美国哈佛大学合作成立哈佛燕京学社，到1930年代已经跻身于世界一流大学之列，在国内外名声大震。

1942年至1945年，因太平洋战争爆发而被侵华日军封闭的燕京大学曾内迁成都办学，抗战胜利后回到北平复校 。在中国高等学校1952年院系调整中，燕京大学被撤销。在香港，基督教教会代表1951年创办了旨在继承燕大等13所内地教会大学精神的崇基学院（后成为香港中文大学成员学院之一）。在中国大陆，其资产由中华人民共和国中央人民政府接管后被整并，文科、理科多并入北京大学，工科并入清华大学，法学院、社会学系并入北京政法学院（今中国政法大学）。校舍由北京大学接收，其建筑仍为燕京大学古迹。

燕大诞生于五四时期，作为那个时代中国高等教育的重要代表，一开始便与学生爱国民主运动结下不解之缘。存在的33年间，这所大学在教育方法、课程设置、规章制度诸多方面，对中国近代高等教育的发展产生了深刻的影响。没有哪所大学能像燕京大学一样，对中国的政治介入如此之深，以至于研究中国近现代政治史都无法绕开燕京大学。五四运动、西安事变、国共内战、学生运动等多次近现代中国的重大事件，都和燕京大学有关。

2、辅仁大学

辅仁大学为直属罗马教廷教育部的天主教大学。1925年由美国本笃会于北京创办，初期设大学预科名为“辅仁社”。1927年北洋政府准予试办，并正式将校名改为辅仁大学。国民政府统一全国后于1929年呈请教育部正式立案。1952年因院系调整并入北京师范大学。现北京辅仁校址为北京定阜大街（北京师范大学辅仁校区）及北京辅仁校友会。1959年中国主教团、圣言会及耶稣会共同参与复校计划，1960年核准在台复校，1961年哲学研究所招生，1963年设立三学院十系组的大学部正式招生。

3、齐鲁大学

齐鲁大学，简称齐大，诞生于1864年（清同治三年），由美北长老会、英国浸礼会共同发起，来自美国、英国以及加拿大的多个基督教教会联合开办，是中国最早的教会大学之一。经过长期发展，齐大发展成一所综合性教会大学。

齐鲁大学全盛时期，老舍、钱穆、顾颉刚、栾调甫、马彦祥、吴金鼎、胡厚宣等学术名家先后在此执教，号称“华北第一学府”，和燕京大学并称“南齐北燕”。学校以医学院实力最强，坊间有“北协和、南湘雅、东齐鲁、西华西”之称。

1952年院系调整，齐鲁大学被撤销建制，其学科分别并入山东大学、山东师范大学、南京大学等高校，校园旧址为今山东大学趵突泉校区，校史由山东大学齐鲁医学院继承。虽然齐大和山大同处山东，但两者历史上少有关联，是不同性质、不同风格、相互独立的。齐鲁大学旧址于2013年3月被国务院核定为第七批全国重点文物保护单位

4、圣约翰大学

圣约翰大学，简称圣约翰、约大，诞生于1879年，初名圣约翰书院，1881年成为中国首座全英语授课的学校。1892年起开设大学课程，1905年升格为大学，是中国第一所现代高等教会学府。1913年开始招收研究生，至1949年春，设有文、理、医、工、神5个学院和附属中学。1952年，约大有教职员工234人，在校学生1381人；校园面积达348亩，建有校舍楼馆、住宅约50所。

圣约翰大学是当时上海乃至中国最优秀的大学之一，也是在华办学时间最长的一所教会学校。美国多所名牌大学皆承认约大学生的学历，并给予直升其研究生院的优待。卜舫济主持圣约翰校政长达53年之久，对学校的发展起到很大影响。该校师生具有反清、反殖民主义的光荣传统，上海历次的学生爱国运动，都有约大学生积极参加。73年的办学历程中，圣约翰大学享有“东方哈佛”、“外交人才的养成所”等盛名，更是培育出了一大批声名显赫的校友。

1949年秋，新闻系并入复旦大学。1952年院系调整，圣约翰大学被撤销，理学院（数学系、物理系、化学系、生物系）、教育系、中文系（部分）并入华东师范大学；外文系、中文系（部分）、历史系并入复旦大学；土木工程系、建筑工程系并入同济大学；机械工程系并入交通大学；医学院参与组建上海第二医学院；经济系并入上海财政经济学院；政治系和校址划归华东政法学院；附中并入上海市五四中学。

5、震旦大学

震旦大学，原名震旦学院，由马相伯神父于1903年2月27日在上海徐家汇天文台旧址创办，是中国近代第一所私立大学。“震旦”一词出自梵文，意即中国，在英语中，亦有黎明、曙光的含义。马相伯将震旦学院喻作旭日东升，担负着以教育开启中国曙光的重任。1905年春，由于天主教耶稣会干涉校政，马相伯带领震旦爱国师生出走成立复旦公学。马相伯是震旦大学的首任校长、董事长和终身校董，尽管同耶稣会有矛盾，仍然是震旦的主要捐助人，并在有生之年运用他的影响支持震旦。

震旦大学为中国近代著名教会大学，曾经有“东方巴黎大学”美誉，是中国第一所开展研究生教育并授予博士和硕士学位的学校，拥有中国第一家博物馆“震旦博物院”（上海自然博物馆前身）。至1947年，震旦大学设有医学院、理工学院、法学院、文学院、震旦女子文理学院和两所附属中学，并附设两所高级护士学校。

1952年秋，在全国高校院系调整中，震旦大学被撤销，其医学院和圣约翰大学医学院、同德医学院在原址合并成立上海第二医学院；其余系科分别并入复旦大学、上海第一医学院、华东师范大学、交通大学、同济大学、华东化工学院、华东政法学院、上海财政经济学院、南京大学、南京师范学院；震旦附中和震旦女附中在震旦女子文理学院原址合并改为上海市向明中学。震旦大学原址现为重庆南路227号和280号上海交通大学医学院校舍。

6、金陵大学

金陵大学，简称“金大”，诞生于1888年（清光绪十四年）的美国基督教会美以美会（卫斯理会）在南京创办的教会大学，同美国康奈尔大学为姊妹大学。当时社会评价为“中国最好的教会大学”，享有“江东之雄”、“钟山之英”之美誉。厉麟似、胡小石、赛珍珠等著名学者都曾在金大任教。

1928年金陵大学首先向教育部注册并批准。在美国加利福尼亚大学对外人在华所办大学编类中，金陵大学是中国教会大学中唯一的A类，持有金大学位的毕业生有资格直接进入美国大学的研究生院。

金陵大学有文理农三院，英语文学和中国文化研究成就卓著，闻名世界。尤其农林学科堪称中国之先驱，享誉海内外。其他方面亦有发展，如开创中国电影教育、首开中国医科七年制教育和博士教育。

金大培养大批优秀人才分布于海内外,在各个领域内发挥所长,使金大饮誉国内外，在中国近代教育史上具有重要影响。为中国现代大学教育的建立与发展、现代科学技术的引进、新的人才培养模式的开创、优秀人才的输送都做出了突出贡献。

1951年，私立金陵大学与私立金陵女子文理学院合并为公立金陵大学。1952年院系调整，金陵大学被撤销建制，文、理学院等并入南京大学合并，部分院系参与组建中国其他高校。其历史档案划归南京大学。南京大学将校址从四牌楼旧址迁至金陵大学鼓楼校址。

7、岭南大学

清光绪十四年（1888年），美国长老会在广州沙基金利埠创办了一所名为格致书院的高等学府。这所学府就是今天在香港复校四十多年的岭南大学的前身。

1948年8月，陈序经接任校长一职，迅即将岭南大学的学术地位提升到一个新的境界。陈序经是著名的全盘西化论的倡导者，在海内外享有盛誉。他立意要将岭南大学打造成全国最优秀的学府。因此他在上任前即向清华大学、中央研究院、协和医学院等一流学术机构挖角，聘请明星级教授十数人。另外，陈序经又以个人的交情和魅力，请来陈寅恪、王力、梁方仲、容庚几位人文学科的国宝级教授加盟，奠定了岭南大学在中国文史界中举足轻重的地位。连同陈序经本人在内，岭南大学优秀的师资在战后的广东造就了一个人文荟萃、精英云集的局面，其盛况可谓一时无两。

1952年底，全国高等院校进行调整，岭南大学的康乐校园变成了中山大学的校园，原有的课程或科系拼入广州其他院校，曾经是国内著名学府的岭南大学正式解体，结束了六十多年曲折而光辉的教育道路。1988年，值岭南大学百年盛典之际，国家教委宣布批准成立中山大学岭南学院，由岭南校友、原广东省副省长王屏山任首任院长。