王邦瑞是明朝中期的一名官员，出生在宜阳人。他在很小的时候，就展现出了很有器量和见识的一面。

在他还是一名青年学生的时候，附近出现了很多盗贼，王邦瑞便懂得向知府呈上剿灭盗寇的十四条计策。

正德十二年时，王邦瑞考中进士。后改任庶吉士。因与王府有亲戚关系，他得以出任广德知州。

嘉靖初年，因祖母去世，王邦瑞离职守孝。后补任滁州知州。

多次升迁后，他担任南京吏部郎中，又出任陕西提学佥事。

但后来又因为岁贡考试不合格者超过五名，王邦瑞被贬为滨州知州。

再次升迁后，他担任固原兵备副使。泾州、邠州的巨盗李孟春，在河东、河西一带流窜抢劫，王邦瑞将他剿平。后来，因祖母去世，他离职守孝。服丧期满后，他又担任陕西提学，转任参政。因母亲去世，他辞官守孝。后被起用提升为右佥都御史，巡抚宁夏。贼寇趁着冰封时节入侵，他设伏兵将其击败。后来，他改任南京大理卿。但还未上任，又被召任兵部右侍郎。

后来，王邦瑞改任吏部，又升任左侍郎。

期间，俺答侵犯都城，皇帝命令王邦瑞总督九门。

当时，王邦瑞在城外屯驻禁军，并巡查军营东西长安街，大开城门，接纳四郊避难的百姓。

兵部尚书丁汝夔被关进监狱，皇帝命令王邦瑞代理他的职务，并兼管团营。贼寇退去后，王邦瑞上奏请求治理诸将的功过，并疏浚九门的护城河，皇帝都批准了。

王邦瑞看到营制长久废弛，极力陈述其弊端。于是，皇帝撤销了十二团营，将其全部归于三大营，让咸宁侯仇鸾统领。

王邦瑞也改任兵部左侍郎，专门负责监督营务。他又上奏陈述了六件应兴应革的事。其中说到宦官掌管军队，是古今的大患，请求全部撤去提督监枪的人。嘉靖皇帝对此答复同意。

接着王邦瑞又举荐前编修赵时春、工部主事申旞懂军事，这些人都得以改任兵部，分别管理京营事务。

不久后，嘉靖皇帝召见兵部尚书翁万达，但翁万达没有来，嘉靖皇帝就转而任命王邦瑞代理一下。

王邦瑞很快就上奏陈述了安定边境的十二件事。

不久后，仇鸾在嘉靖皇帝面前诬陷王邦瑞，使得嘉靖皇帝对他的眷顾渐渐减少。

恰逢仇鸾上奏要革去蓟州总兵官李凤鸣、大同总兵官徐珏的职务，而推荐京营副将成勋代替李凤鸣，密云副将徐仁代替徐珏。

嘉靖皇帝的旨意听从了仇鸾的建议。

王邦瑞就此上奏表示：“朝廷更换将帅，向来必须向公卿们征询意见，最后由皇帝亲自做出决断，这样做是为了慎重防微杜渐，表明臣下不敢专权。况且京营的大将与各镇的将帅互不统属，不知为什么京营竟有权罢免各镇的将帅。”

“现在皇帝你却曲意顺从仇鸾的请求，我担心边境的将帅都奔走钻营，依附权贵，这不是国家的福气啊。”

嘉靖皇帝对此感到很不高兴，下旨斥责了王邦瑞一番。

接着，仇鸾又想节制边将，罢免修筑蓟镇边墙。王邦瑞都认为不可行。

这让仇鸾非常怨恨，便更加竭力地诬陷他。恰逢王邦瑞又上奏陈述安定边境的大计，嘉靖皇帝就下严旨将他削职，以冠带留任办事。

过了几天后，王邦瑞自己上奏陈述。嘉靖皇帝竟将他除名，让赵锦代替他。

王邦瑞离职后，仇鸾更加骄横。第二年，仇鸾被诛杀，赵锦也因结党营私被发配戍边，于是嘉靖皇帝渐渐又思念起王邦瑞的好。

过了十年后，由于京营缺少人手，嘉靖皇帝便说：“非王邦瑞不可。”

于是乎便下旨，重新起用王邦瑞恢复原职。

王邦瑞到任后，上疏奏请了几件便民利国的事，嘉靖皇帝都批准实行。

仅仅过了一年后，嘉靖皇帝去世了。追赠他为太子少保，谥号襄毅，派遣行人护送他回乡安葬。

王邦瑞严厉刚毅，有识见和气度。他做官四十年，以廉洁守节而著称。