尽管南非是世界上艾滋病毒感染者人数最多的国家，但在控制疫情方面取得了长足的进步。现在，配备了MGI的先进测序工具和技术，南非医学研究委员会（SAMRC）和夸祖鲁-纳塔尔大学（UKZN）的研究人员正在逐步找到自然控制艾滋病毒感染的答案。

根据人类科学研究委员会的数据，2022年南非约有780万人感染艾滋病毒。然而，尽管非洲拥有世界上最大的遗传多样性，但非洲人类基因组序列是全球测序的所有人类基因组中最低的。因此，迫切需要利用基因组学来支持和扩大有针对性的干预计划，使更多的艾滋病毒感染者得到有效治疗。

全球对HIV的研究尤其对精英控制者（EC）这一特殊群体特别感兴趣，这是一组罕见的HIV-1阳性个体，他们的免疫系统似乎可以在不服用抗逆转录病毒药物的情况下抑制艾滋病毒的发展。每200名艾滋病毒感染者中，大约有一人可能是精英控制者。在南非，艾滋病毒感染率很高，EC的患病率似乎也更高。通过研究“揭开”EC的秘密，可以揭示线索，并可能开发出新的疗法，使更广泛的患者群体受益。

为了确定非洲裔个体中的多态性和突变，以及它们与HIV疾病进展的关系，UKZN和Thumbi Ndung'u教授于2019年与SAMRC、MGI和南非当地诊所合作，利用全基因组测序将他们20多年来在EC研究方面的工作提升到了一个新的水平。

项目联合研究员说，“在MGI的支持下，我们在开普敦启动了SAMRC的非洲基因组学中心，同时启动了HIV宿主基因组项目，该合作伙伴关系使MGI制定了高通量测序工作流程，并协助我们在实验室进行了专门的规模化基础设施设计。我们的项目着眼于精英控制者，以确定疾病的进展方式和宿主导向的先天免疫控制机制。此外，我们还纳入了家庭数据，以发现可能有助于宿主免疫控制艾滋病毒的遗传差异。”