导语

随着生物技术（高通量测序技术与质谱）的创新发展，多组学数据爆发式产生。基于这些组学数据的研究，加速了生命科学的发现。然而，这些有价值的数据散落在大量的文献之中。因此，非常有必要整合这些数据，实现数据高效查询、可视化和深度分析，助力科学研究。元莘生物提供优质组学数据库开发服务，致力挖掘个性化的组学数据和共享解决方案。

数据库产品分类

应用：疾病研究、生物表型研究、进化研究、种质资源保护研究等

数据库开发原理

数据库开发技术

技术优势

服务流程

注：服务周期3~6个月

效果展示

成功案例

ctcRbase （Gene expression database of circular tumor cells/ microemboli）是一个收集各种癌症类型中循环肿瘤细胞/微栓子（CTCs / CTM）表达数据的数据库，包括长链非编码RNA （lncRNA）和通过RNA-seq数据分析得出的信使RNA （mRNA）。CTCs / CTM是指从癌性病变中脱离并脱落到血液中的肿瘤细胞。CTCs / CTM分析可以实现对晚期癌症的非侵入性监测，以及肿瘤转移的早期检测。ctcRbase提供原发肿瘤、CTCs / CTM和白细胞（WBC）的表达水平。此外，还提供了肿瘤转移的表达水平。构建了一个易于使用的界面来查询和浏览CTCs / CTM中的基因表达。

数据库连接：http://www.origin-gene.cn/database/ctcRbase/

疾病相关长链非编码RNA数据库（lncRNAdisease2.0）是从文献和其他资源中集成了综合的，实验支持的和预测的ncRNA-疾病关联的多种lncRNA，将LncRNADisease数据库更新到2.0版本。LncRNADisease v2.0的更新包括：（I）与以前版本相比，ncRNA-疾病关联增强了40倍以上;（Ii）集成了实验支持的圆环RNA-疾病关联;（Iii）提供了ncRNA、mRNA和miRNA之间的调控关系;（iv）将疾病名称映射到疾病本体和医学主题标题（Mesh）;（V）为每个ncRNA-疾病关联提供了一个置信度评分。

数据库链接：http://www.rnanut.net/lncrnadisease/

项目文章

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[2] Zhao， L.， Wu， X.， Li， T.， Luo， J.， & Dong， D. （2020）.ctcRbase：循环肿瘤细胞和微栓子的基因表达数据库。数据库， 2020， baaa020.

[3] 白， X.， 杨， X.， Wu， L.， Zuo， B.， Lin， J.， Wang， S.， ...&赵，H.（2019）。CMTTdb：癌症分子靶向治疗数据库。转化医学年鉴，7（22）。

[4] Bao， Z.， Yang， Z.， Huang， Z.， 周， Y.， Cui， Q.， & Dong， D. （2019）.LncRNADisease 2.0：长链非编码RNA相关疾病的更新数据库。核酸研究，47（D1），D1034-D1037。

[5] Yang， Z.， Wu， L.， Wang， A.， Tang， W.， Zhao， Y.， Zhao， H.， & Teschendorff， AE （2017）.dbDEMC 2.0：更新了人类癌症中差异表达的miRNA数据库。核酸研究，45（D1），D812-D818。